Enzymer är viktiga molekyler – de katalyserar reaktionerna som gör livet hända. Naturen har en anmärkningsvärd mängd av enzymer som katalyserar en mängd olika reaktioner. Vid jämförelse av dessa enzymer , kan det ibland vara bra att betrakta dem utifrån deras katalytisk effektivitet , även kallad specificiteten konstant , som mäter hur effektivt enzymet omvandlar substratet ( molekylen den agerar på ) i produkten . För enzymer som följer vad biokemister kallar Michaelis – Menten kinetik , kan denna konstant lätt beräknas från experimentella data . Instruktioner
1
Skriv ner Km och kcat . Dessa konstanter bestämmas experimentellt , så du bör redan ha det innan du börjar att försöka beräkna specificiteten konstant. Köpa 2
Minns att Km representerar ( k – 1 + k2 ) /k1 , där k1 är hastighetskonstanten för bildning av ett enzym – substratkomplex, k – 1 hastighetskonstanten för upplösning av det komplexa, och k2 är hastighetskonstanten för bildning av en produkt från enzym – substratkomplex . En annan ( och kanske mer upplysande ) sätt att definiera Km är då koncentrationen av substrat när reaktionen går på halva den maximala hastigheten . Om ett enzym har en stor Km , det tar en hel del underlag för att nå enzymets högsta skattesatsen , medan en liten Km betyder bara behövs en liten substrat för att mätta den tillgängliga enzymet .
3
Minns att kcat är hastighetskonstanten för det hastighetsbegränsande steget i enzymkatalyseradereaktionen . Det hastighetsbegränsande steget är den långsammaste steget eller flaskhals som bestämmer hur snabbt samlade reaktionen kan köras .
4
Divide kcat från Km få specificiteten konstant. Till exempel, om kcat är 600 sekunder ^ -1 och Km är 10 mikromolar , då den katalytiska effektiviteten är 60 mikroM ^ -1 s ^ -1 .
5
Observera att graden av diffusion sätter en övre gräns på maximalt katalytisk effektivitet , oftast i storleksordningen 10 ^ 8-10 ^ 9 M ^ -1 s ^ -1 . Biokemister kommer ibland att säga att ett enzym vars katalytiska effektiviteten närmar sig denna gräns har uppnåtts ” katalytisk perfektion ” . Addera